Se construyeron 150 ejemplares de MD-88, que fue la última versión del MD-80. Se diferenciaba de las versiones anteriores en la incorporación de EFIS y sistema de aviso de windshear (esto último se vendía como opción en otros MD-80 y DC-9s), aparte de otros menores cambios interiores. Aparte de Delta, uno de los principales operadores del MD-88 fue Aviaco y por ende, Iberia.